在2025赛季足协杯第3轮，三支出战的中超球队有不同的表现，浙江队顺利晋级，武汉三镇则被淘汰出局，连续2个赛季足协杯一轮游。

2025赛季的足协杯共有64支球队参加，其中16支中超球队在第三轮才出战，分别对阵低级别球队。按照规则，中超球队在对阵中甲球队时，最多允许3名外援出场，而在对阵中乙球队时，华裔入籍球员可以出场，外援、港澳台以及非华裔入籍球员无法出场。

值得一提的是，在第二轮，南通支云被中乙球队无锡吴钩淘汰。除了无锡吴钩之外，广州蒲公英、广西恒宸、贵州筑城竞技三支中乙球队也淘汰各自对手晋级。

在第三轮首个比赛日，广州蒲公英主场对阵浙江队，王钰栋第20分钟打入足协杯处子球，浙江队最终以1比0的比分战胜广州蒲公英后晋级。遗憾的是，王钰栋此役因伤退场。

陕西联合主场对阵武汉三镇，客队派出全华班，而陕西联合则派上两名外援。比赛的第16分钟，钟晋宝吊射破门，为武汉三镇首开纪录。比赛的第48分钟，阿卜杜瓦哈普小角度头球冲顶破门，达尔法卢第59分钟再入一球，陕西联合最终2比1逆转战胜武汉三镇。

武汉三镇成为本赛季第一支被淘汰出足协杯的中超球队，连续2年足协杯首战就被淘汰出局，而陕西联合则成为第一支晋级足协杯16强的中甲球队。

中乙球队广西恒宸主场对阵梅州客家，季胜攀为梅州客家首开纪录，但郭梓承第30分钟为广西恒宸扳平比分。比赛的第72分钟，高翊轩远射被孙健祥封出，黄雍海补射破门，2比1！

最终，广西恒宸逆转战胜梅州客家之后晋级16强，成为本赛季第一支晋级足协杯16强的中乙球队。

在第三轮比赛全部结束之后，足协杯将再次进行抽签，决定余下轮次的对阵以及主客场安排。